המחילה
סיטואציית הניצחון של הדרסלים נמשכת שלושה ימים. לאחריהם, רון וויזלי, פרד וויזלי וג'ורג' וויזלי, שהיו מודאגים מכך שלא שמעו מהארי כל הקיץ, משאילים את המכונית המעופפת של אביהם בכדי לבוא ולהציל אותו. בדרכם חזרה אל המחילה הארי מספר להם על האזהרה של דובי. כולם מחליטים שסביר כי מישהו ממשפחה עשירה שלח את דובי כדי שיעשה מהארי צחוק, וחושדים מיד בדראקו מאלפוי. כשהארי מגיע למחילה, ביתם של הוויזלים, הוא חושב שהבית פשוט מקסים. מולי וויזלי, שהייתה מודאגת כשגילתה שבניה לא נמצאים במיטתם, צועקת על שלושת הוויזלים ושולחת אותם לסלק נומים מהחצר. הארי מתנדב לעזור להם.
כאשר ארתור וויזלי חוזר מעבודתו באותו הבוקר, הוא מכיר לראשונה את הארי ולא מתרגש מכך שבניו השתמשו במכונית המעופפת. מולי מזכה גם אותו במנה של צעקותיה. ג'יני וויזלי, שתיסע להוגוורטס בפעם הראשונה השנה, נבוכה מעצם נוכחותו של הארי.
"הבנים שלך הטיסו את המכונית הזאת אתמול בלילה עד לבית של הארי ובחזרה!" צעקה גברת וויזלי. "אז מה יש לך להגיד, אה?"
"באמת?" שאל אדון וויזלי בהתרגשות. "והכל פעל כמו שצריך? כלומר," הוא גימגם בעוד עיניה של גברת וויזלי יורות גיצים, "מה שעשיתם היה מאד לא בסדר, בנים - מאד, מאד לא בסדר..."
אצל כרך ודף בע"מ
הארי נשאר אצל הוויזלים במשך שארית חופשת הקיץ. כאשר היה עליהם ללכת לסמטת דיאגון כדי לקנות את הציוד לשנת הלימודים, האבק של אבקת הפלו הפריע להארי בנשימתו, והוא ביטא את המילים "סמטת דיאגון" באופן שגוי. כתוצאה מכך הארי מגיע לחנות "בורגין וברקס" שממוקמת בסימטה עוינת בשם סמטת נוקטורן ומוכרת חפצי אופל. הארי מבחין בלוציוס מאלפוי, אביו של דראקו מאלפוי, מוכר חפצי אופל לבעל החנות. מאלפוי מסביר כי משרד הקסמים עושה פשיטה על מספר בתים שיש בהם חפצי אופל, ולכן עליו למכור את החפצים שברשותו. בנוסף, הוא מדבר על הבוז שהוא רוכש למדיניות ההגנה על חפצי מוגלגים, שארתור וויזלי עומד מאחוריה.
כאשר הארי עוזב את החנות הוא פוגש במזל את רובאוס האגריד, שמחזיר אותו לוויזלים שנמצאים בדיאגון יחד עם הרמיוני גריינג'ר והוריה. בחנות הספרים "כרך ודף בע"מ" הם פוגשים בסופר המפורסם גילדרוי לוקהרט שמספר להם כי הוא יהיה המורה החדש להתגוננות מפני כוחות האופל. כשלוקהרט מבחין בהארי, הוא מכריח אותו להצטלם איתו לעמוד השער של "הנביא היומי". מאוחר יותר, הם פוגשים בחנות את דראקו מאלפוי ואת אביו. לוציוס מתגרה בארתור ובמשפחתו ללא הרף ובסופו של דבר ארתור מזנק עליו.
הערבה המפליקה
בקינג קרוס, הארי ורון מנסים לעבור דרך הקיר אל רכבת האקספרס להוגוורטס, אך בדרך מסתורית נחסמת דרכם. כאשר הם מבינים כי הפסידו את הרכבת, הם לוקחים את המכונית המעופפת של מר וויזלי ועפים איתה להוגוורטס. בזמן שהם עפים, מספר מוגלגים מבחינים במכונית, וכאשר הם מגיעים לבית הספר הם מתרסקים היישר לתוך הערבה המפליקה. פרופסור סוורוס סנייפ מנצל את ההזדמנות כדי לנסות לסלק את השניים מבית הספר, אך נכשל בניסיון השכנוע של אלבוס דמבלדור. יחד עם זאת, ניתנה לבנים אזהרה וריתוק. במקביל, ג'יני מתמיינת לבית גריפינדור, כמו שאר בני וויזלי.
גילדרוי לוקהרט
ביום שלאחר מכן רון מקבל צרחן מאימו.
גם להארי וגם לרון השיעור הראשון במערכת היה שיעור התגוננות מפני כוחות האופל יחד עם הפרופסור גילדרוי לוקהרט. צורת הלימוד שלו התגלתה עד מהרה כאסון מוחלט. לצערו הרב של הארי הוא מקבל תשומת לב רבה מלוקהרט ומתלמיד שנה ראשונה, קולין קריווי. שניהם מתקשרים איתו על בסיס הפרסום שלו. קולין מתייחס להארי כלמפורסם ולוקהרט באמת מקווה להביא אותו למעמד הזה. הארי גם מתמודד עם יחס לא רצוי מצידה של ג'יני, אם כי באופן פחות תוקפני.
בוצדמים וקולות מוזרים
לקבוצת הקווידיץ' של גריפינדור יש אימון מוקדם בשבת בבוקר, בו הם מקבלים הדרכה על אסטרטגיה חדשה שעליה עבד אוליבר ווד כל הקיץ. בזמן שהם מתאמנים, קבוצת הקווידיץ' של סלית'רין מגיעה עם מטאטאי נימבוס 2001 חדשים ומתחיל ויכוח על השימוש במגרש. במהלך העימות מתברר כי דראקו הוא המחפש החדש של הקבוצה וזה שאחראי על המטאטאים החדשים שלה. מאלפוי קורא להרמיוני "בוצדמית" ורון מנסה לקלל אותו, אך מכיוון ששרביטו נפגם בזמן ההתרסקות עם המכונית המעופפת, הלחש מתהפך והוא רץ לבקתה של האגריד כשהוא מקיא חשופיות.
העונש שקיבל הארי כתוצאה מהטיסה במכונית המעופפת הוא לעזור ללוקהרט לענות על מכתבי המעריצים שלו. רון לעומתו, היה צריך להבריק את הגביעים של בית הספר. במהלך העונש שלו, הארי שומע קול ערטילאי ומאיים שלוקהרט עצמו לא שומע.
מסיבת יום-המוות
הארי כמעט ומקבל עונש נוסף כשהוא נכנס לטירה מלוכלך בבוץ. ניק-כמעט-בלי-ראש מסיח את דעתו של פילץ' בזמן שהארי בורח, והארי בתמורה מבטיח לניק שישתתף במסיבת יום-המוות שלו שתתקיים בליל כל הקדושים. הארי לוקח איתו למסיבה גם את רון ואת הרמיוני, אך עד מהרה נמאס לשלושתם מהמסיבה והם מתחילים לחזור לכיוון האולם הגדול. לפני שהם מגיעים ליעדם הארי שומע את הקול הערטילאי פעם נוספת ועוקב אחריו לקומה השנייה. שם, הוא מוצא בית שימוש מוצף ואת גברת נוריס, החתולה של פילץ', מאובנת. מסר נכתב על הקיר באמצעות דם: חדר הסודות נפתח. גורו לכם, אויבי היורש.
גברת נוריס, חתולת השרת, הייתה תלויה בזנבה מזרוע הברזל שהחזיקה את הלפיד. היא הייתה נוקשה כמו קרש, עיניה פקוחות לרווחה במבט ריק.
הכתובת על הקיר
פילץ' וסנייפ מנסים לסבך את הארי בצרות היות והוא נתפס ליד כתובת הדם, אבל דמבלדור אומר שמדובר בקסם אופל חזק שאף תלמיד בשנה השנייה לא יכול להטיל. נקבע כי סנייפ ייצר שיקוי דודאים שמסוגל להעיר את גברת נוריס.
הרמיוני צמאה למידע בנוגע לחדר הסודות, ומבקשת מפרופסור בינס לספר עליו באחד משיעוריו. לאחר שלא הצליח למצוא מוצא מבקשתה, הוא מסביר שבין מייסדי בית הספר היו חילוקי דעות באשר לקבלתם של בני מוגלגים ללימודים. כאשר העימות התגבר, סלזאר סלית'רין עזב את בית הספר. לפי האגדה, הוא בנה לפני שעזב חדר סודי במקום כלשהו בבית הספר, שרק יורשו יוכל לפתוח. בתוך חדר הסודות ישנה מפלצת שרק היורש של סלית'רין יכול לשלוט בה, וברגע שתשוחרר, תנקה את בית הספר מבני המוגלגים. פרופסור בינס מנסה להסביר לכיתה ללא הצלחה שהחדר לא באמת קיים ושבבית הספר נערכו חיפושים מקיפים אחריו, אך ללא הועיל.
המרביצן הסורר
הארי, רון והרמיוני חושדים שהיורש של סלית'רין הוא דראקו מאלפוי. כדי להוכיח זאת הרמיוני מציעה להשתמש בשיקוי פולימיצי, שיכול להעניק לאדם חזות של אדם אחר למשך שעה. השלושה משיגים מלוקהרט אישור לשאול את הספר "שיקוי השיקויים" ממדור הספרים המוגבלים בספרייה. מכיוון שאף אחד לא נכנס לשירותים של מירטל המייללת, הם מחליטים שזהו המקום הבטוח ביותר לרקוח בו את השיקוי.
במהלך החודש בו הרמיוני עובדת על השיקוי, מתקיים משחק קווידיץ' בין גריפינדור לבין סלית'רין, במהלכו אחד המרביצנים עוקב בכפיתיות אחר הארי. היה ברור שהמרביצן קולל. תוך שהמרביצן שובר את זרועו הימנית, הארי מצליח לתפוס את הסניץ' ובית גריפינדור מנצח במשחק. לוקהרט, שמנסה ברשלנות לרפא את זרועו של הארי, מעלים ממנה את כל העצמות. מדאם פומפרי מטפלת בהארי באמצעות שיקוי "הפלא ושלד" והארי מוכרח להישאר במרפאה במשך הלילה.
במהלך הלילה, דובי מופיע שוב ומספר להארי שהוא זה שכישף את המרביצן, כדי לגרום להארי לעזוב את בית הספר. עוד, הוא מספר לו שהוא זה שמנע ממנו להגיע לרציף תשע ושלושה רבעים, בתקווה שלא יצליח להגיע להוגוורטס. בטעות, הוא אף מספר להארי שחדר הסודות נפתח כבר בעבר. לאחר שדובי נעלם, דמבלדור, מקגונגל ומאדם פומפרי נכנסים למרפאה עם קולין קריווי שהתאבן גם הוא. סרט הצילום במצלמה שלו נשרף.
מועדון הדו-קרב
הארי נרשם למועדון הדו-קרב של גילדרוי לוקהרט. בעצתו של סנייפ (שעוזר ללוקהרט לאמן את הקבוצה), הארי נלחם במאלפוי, וזה האחרון מעלה משרביטו נחש שמטרתו לתקוף את הארי. לוקהרט מנסה לגרש אותו, אך כל מה שהוא מצליח לעשות זה להעיף אותו על התלמידים.
הנחש מתקרב לתלמיד הפלפאף בשם ג'סטין פינץ'-פלצ'לי, והארי שמבחין בכך קופץ מהבמה וצועק לנחש לחדול מתקיפה. להפתעתו הגדולה, הנחש עוצר במקומו. הארי מצפה שג'סטין יהיה אסיר תודה על שהציל את חייו, אבל כל מה שהוא ושאר התלמידים ראו היה את הארי מדבר לחשננית, שפת הנחשים. מכיוון שלא הבינו את דבריו, רבים הסיקו שהארי הורה לנחש לתקוף את ג'סטין.
מאוחר יותר, מתברר להארי שלחשננית היא כשרון נדיר מאוד שהיה מזוהה עם סלזאר סלית'רין. הארי נהפך, בעקבות כשרונותיו, לחשוד העיקרי של תלמידי הוגוורטס בדבר שחרור המפלצת מחדר הסודות.
כששיעור תורת הצמחים מתבטל באחד מימות השבוע, הארי נפגש עם האגריד שמספר לו שתרנגולות נהרגות בצורה מסתורית בהוגוורטס. שנייה לאחר שעזב את האגריד, הארי מבחין בג'סטין פינץ'-פלצ'לי מאובן במסדרון. פיבס מגיע למקום וממהר להקים המולה, ותלמיד הפלפאף בשם ארני מקמילן טוען שהארי נתפס על חם.
שיקוי הפולימיצי
הארי נלקח למשרדו של דמבלדור, שם הוא רואה את עוף החול שלו נשרף, הופך לאפר ונולד מחדש. דמבלדור אומר שהוא לא מאמין שהארי אחראי לתקיפות.
לאחר שנודע לה שדראקו, קראב וגויל נשארים בטירה למשך חג המולד, גם השלישייה מחליטה להישאר, זאת כדי להשתמש בשיקוי הפולימיצי. בערב חג המולד, הם מפתים את קראב ואת גויל לאכול עוגות שוקולד ממולאות בשיקוי מרדים. הם לוקחים את הנעלים שלהם וכן דגימה מהשיערות שלהם, ומחביאים אותם באחד מארונות השירות. הרמיוני משתמשת בשערה מגלימתה של מיליסנט בלסטרוד, אך מגלה שהשערה שייכת למעשה לחתול שלה. כתוצאה מכך היא הופכת לחתולת אדם ונאלצת להישאר שבועות ארוכים במרפאה.
בדמותם של קראב וגויל, הארי ורון חוקרים את מאלפוי בחדר המועדון של סלית'רין. הם מגלים שהוא לא היורש של סלית'רין. עוד, מגלים שלפני חמישים שנה, כשהחדר נפתח, ילדה בת מוגלגים נרצחה והאחראי לפתיחתו של החדר סולק מהוגוורטס. דראקו אף מזכיר את אוסף חפצי האופל הסודי של אביו.
היומן הסודי ביותר
מספר שבועות לאחר מכן הארי ורון מוצאים את השירותים של מירטל מוצפים. מירטל, הרוח הזועפת והבוכיה, מסבירה שמישהו הוריד יומן באסלה והוא נפל עליה. הארי מרים אותו, ומגלה שהיומן שייך למישהו בשם ט.ו.רידל, ושהוא ריק לחלוטין. רון זוכר מתקופת הריתוק שלפני חמישים שנה תלמיד באותו השם זכה בפרס על תרומה מיוחדת לבית הספר. לטענתה של הרמיוני, בהתחשב בכך שחדר הסודות נפתח לפני חמישים שנה, טום רידל קיבל את הפרס על תפיסת האחראי לפתיחת החדר באותם הזמנים. למרות שנסיונותיו להוציא מידע מהיומן נכשלו, הארי מרגיש צורך מוזר לשמור עליו.
ביום האהבה הארי ורון מאוכזבים לגלות שלוקהרט פיזר בכל בית הספר גמדונים שמחופשים לדמותו של קופידון. אחד הקופידונים מנסה להקריא להארי מסר אהבה מזמר שנשלח אליו, ובעוד שהארי מנסה להתחמק הוא נופל, מיכל הדיו מתנפץ והדיו נשפך על חפציו. ג'יני, שעמדה בסמוך אליו, מבחינה שהיומן נמצא אצלו.
למרות שהדיו נשפך על היומן, להפתעתו של הארי הוא לא מוכתם כלל. הוא מנסה לכתוב ביומן וזכרונותיו של רידל עונים לו בחזרה. רידל מסביר שהוא היה זה שתפס את האיש שפתח את חדר הסודות בפעם הקודמת ושהוא יכול להראות להארי מה קרה. הארי מסכים ונשאב לתוך "הקלטה" של אחד מהזכרונות שכתב רידל ביומן. הוא רואה את המנהל הקודם של הוגוורטס, ארמנדו דיפט, מודיע לרידל שבית הספר ייסגר בעקבות התקיפות בבית הספר. רידל שחושש לחזור לבית היתומים המוגלגי בו התגורר, עוצר לכאורה את האגריד משחרור עכביש ענק שגידל בבית הספר. מאז, הארי תוהה אם האגריד היה זה שפתח את חדר הסודות לפני חמישים שנה ואם הוא אחראי לכך גם עכשיו.
קורנליוס פאדג'
הארי, רון והרמיוני מחליטים לא לשאול את האגריד על מעורבתו בפרשה, בתקווה שהתקיפות יעצרו. ארבעה חודשים לאחר התקיפה של ג'סטין הקול הערטילאי שומר על שקט והתקיפות פוסקות, אך בכל זאת דברים מוזרים ממשיכים לקרות: יום אחד כאשר הארי חוזר לחדרו הוא מוצא אותו מבולגן לחלוטין. רון חושב שמישהו חיפש משהו והארי שם לב שהיומן של טום רידל נעלם.
יום אחד לאחר מכן, משחק הקווידיץ' שנקבע בין גריפינדור להפלפאף מתבטל עקב תקיפה נוספת, והארי שומע שוב את הקול. מינרווה מקגונגל מזמנת את הארי ואת רון ומובילה אותם למרפאה, שם הם רואים את הרמיוני מאובנת. מקגונגל מספרת כי היא נמצאה מחוץ לספרייה עם מדריך מרייבנקלו, מחזיקה מראה קטנה. מקרה זה הוריד את הארי מרשימת החשודים של תלמידי בית הספר, שכן היה במגרש הקווידיץ' בזמן שהתרחשה התקיפה. משהרמיוני נתקפה, הארי ורון מחליטים שאין מנוס מלדבר עם האגריד.
בהגיעם לבקתה של האגריד, הם מצליחים להסתתר בדיוק לפני שקורנליוס פאדג' ודמבלדור דופקים על דלתה. שר הקסמים מכריז כי בעקבות עברו של האגריד והמוארעות האחרונים, הוא נשלח לאזקבאן כאמצעי זהירות. במהרה גם לוציוס מאלפוי מצטרף אליהם ומודיע שהוא, יחד עם חבר המנהלים, החליטו פה אחד להדיח את דמבלדור מתפקידו בטענה שהוא נכשל בניסיונו לעצור את התקיפות. גם האגריד וגם דמבלדור נושאים מילים אחרונות - האגריד אומר שאם מישהו מחפש אחר תשובות הוא צריך "לעקוב אחר העכבישים", ודמבלדור אומר שהוא יעזוב באמת רק כאשר אחרון הנאמנים לו בבית הספר יסתלק גם הוא. הוא גם הדגיש שעזרה תינתן תמיד בהוגוורטס למי שיזקק לה.
"ואולם," אמר דמבלדור, מדבר לאט וברור, כדי שאף אחד מהם לא יפסיד מלה מהנאמר, "אתה תגלה שאני אעלם מבית הספר הזה באמת, רק אחרי שלא ישאר כאן איש שנאמן לי. ותגלה גם שתמיד תינתן עזרה בהוגוורטס למי שיבקש אותה."
לחלקיק שנייה, הארי היה כמעט בטוח שעיניו של דמבלדור נחו לרגע על הפינה שבה הוא ורון מתחבאים.
הרעגוג
הארי ורון מחליטים להקשיב לעצתו של האגריד ולעקוב אחר העכבישים.
העקבות של העכבישים (שברחו כולם מהוגוורטס) לקחו אותם אל היער האסור. בפרק אנו מגלים שלרון יש פוביה מעכבישים. עם זאת, העובדה שהרמיוני מאובנת ושיש בידם את הכוח לעזור לה אילצה אותו להמשיך בדרך.
בקרחת יער גדושה באלפי עכבישים, השניים פוגשים את הרעגוג, עכביש ענק שנחשב למפלצת של סלית'רין כשהחדר נפתח לפני חמישים שנה. הרעגוג מסביר להם שהאגריד חף מפשע, אך במקום לתת להם ללכת הוא מחליט שיהיו "ארוחת הערב" של צאציו. באותו הרגע, מופיעה המכונית המעופפת (שהפכה פראית בחסות היער) ועוזרת להם להיחלץ.
הארי ורון מרגישים שהם הגיעו למבוי סתום עד שניצוץ אחרון של תקווה מופיע בהם. הרעגוג אמר שהקורבן האחרון של המפלצת מת בחדר שירותים, והארי מבין שמדובר במירטל המייללת. כמובן שעם השמירה הכבדה במסדרונות הוגוורטס היה כמעט בלתי אפשרי להתגנב לשירותי הבנות.
חדר הסודות
מאוחר יותר באותו היום הארי ורון מצליחים להוליך שולל את לוקהרט וכמעט להגיע אל חדר השירותים. בדיוק כשהם חושבים שהם הצליחו, הם נתפסים על-ידי פרופסור מקגונגל והארי נאלץ לספר לה שהם הולכים לבקר את הרמיוני במרפאה. לכן, היה עליהם ללכת למרפאה עם פרופסור מקגונגל כדי שהסיפור שלהם יראה אמין. כאשר הם מתיישבים ליד הרמיוני המאובנת הארי שם לב לפיסת נייר שנמצאת בידה. פיסת הנייר חושפת את מה שהרמיוני גילתה לפני שהותקפה: המפלצת של סלית'רין היא מלך הנחשים, נחש ענק שנקרא בסיליסק. הארי הוא הלחשנן היחיד בסביבתו, וזה מסביר מדוע היה היחיד ששמע את הקול הערטילאי. הבסיליסק הורג אנשים בכך שהוא מסתכל להם ישירות בעיניים, אך כאשר מביטים בעיניו בעקיפין - מתאבנים. קולין קריווי ראה אותו דרך המצלמה, ג'סטין ראה אותו דרך ניק-כמעט-בלי-ראש (שהיה כבר מת ועל כן לא נהרג גם הוא), גברת נוריס ראתה את השתקפותו במים שהיו על רצפת השירותים והרמיוני החזיקה מראה כדי לראות מה נמצא מאחוריה. הייתה גם הערה על כך שעכבישים פוחדים מהבסיליסק (מה שמסביר למה כל העכבישים ברחו מאיזור הטירה), ושקריאת התרנגולת יכולה להיות קטלנית עבורו (מה שמסביר את מקרי המוות של התרנגולות בשטחי הטירה). על פיסת הנייר הרמיוני רשמה מילה אחת, "צינורות". כלומר, הנחש מסתובב בטירה דרך הצנרת.
אחרי שפתרו את התעלומה, הארי ורון החליטו ללכת לחדר המורים ולדווח למקגונגל על מה שגילו. כשהם מגיעים לשם הם שומעים את המורים מדברים על תלמידה שנחטפה לחדר הסודות על-ידי היורש. הם מחליטים להסתתר ולשמוע פרטים נוספים. ברגע השיא הם שומעים את שמה של הנערה - ג'יני וויזלי - אחותו הצעירה של רון, שמוכה בהלם לנוכח המידע החדש. היורש השאיר מסר נוסף על הקיר: "השלד שלה יירקב לנצח בחדר הסודות". בית הספר עומד להיסגר ביום שלמחרת. המורים מפצירים בלוקהרט להתמודד עם המפלצת, שהרי פיזר הבטחות על גדולתו ועל יכולותו להתמודד עימה. לוקהרט חוזר לחדרו, מפוחד ומדוכדך.
באותו הלילה הארי ורון מבינים שאם הבסילסיק משתמש בצנרת, ואם בפעם האחרונה בה נפתח חדר הסודות מירטל נהרגה בחדר השירותים בו היא שוכנת - הכניסה לחדר חייבת להיות בחדר השירותים של מירטל המייללת. היות והם מרגישים חסרי תועלת לחלוטין, מחליטים הארי ורון לשתף את לוקהרט במידע שלהם בתקווה שיצליח במשימתו.
כשהם מגיעים למשרד שלו, הארי ורון מוצאים את לוקהרט אורז את חפציו ומתכונן לברוח. באותה הזדמנות לוקהרט מספר לשניים שהוא לא האדם שביצע את כל מעשי הגבורה עליהם כתב בספריו. למעשה, הטיל לחש זיכרון על הגיבורים האמיתיים של האירועים השונים והתפאר במעשיהם. לוקהרט מנסה להטיל לחש זיכרון גם על הארי ועל רון כדי לשמור על הסוד שלו, אך הארי ממהר לפרוק אותו מנשקו. תחת איום, הם מובילים אותו לחדר השירותים של מירטל המייללת, שמספרת כיצד מתה, ואומרת שהדבר האחרון שראתה היה זוג עיניים ענקיות באחד מהכיורים, שהברז שמחובר אליו אף פעם לא עובד. בברז המדובר הארי מוצא תחריט של נחש. הוא מורה לברז להיפתח בלחשננית, וזה שוקע מטה וחושף צינור עבה במיוחד - הכניסה לחדר הסודות. הארי, רון ולוקהרט מחליקים במורד הצינור ומוצאים עצמם עמוק מתחת להוגוורטס ולאגם הגדול, במעין תעלה דמויית מבוך. במערה הם נתקלים בנשל של נחש עצום מימדים. אז, לוקהרט מזייף התעלפות, גונב את השרביט של רון ומכריז על שיימחק את זיכרונם ויטען שאיבדו את שפיותם למראה גופתה המבותרת של ג'יני. לוקהרט מטיל את הלחש, אך לא מודע לכך ששרביטו של רון שבור. הקסם מתהפך, פוגע בלוקהרט עצמו וגורם לחלק מתקרת המערה לקרוס פנימה. כך, נלכד הארי בחלק של המערה אשר מוביל לחדר הסודות, בעוד רון ולוקהרט בחלק שקרוב יותר לבית הספר. לרון לא הייתה ברירה אלא להישאר מאחור ולנסות לפלס דרך בין גושי האבן בזמן שהארי ממשיך להתקדם בכיוון החדר ולחפש את ג'יני. לאחר זמן מה הארי נתקל בדלת ובה שני נחשים מלופפים. בהוראתו הלחשננית, נפתחת הדלת והוא ניצב בכניסה לחדר הסודות.
היורש של סלית'רין
בתוך החדר, מתחת לפסל גדול של סלזאר סלית'רין ובסמוך לעמודי אבן מעוטרים בנחשים מגולפים, מוצא הארי את ג'יני דוממת וקרה. הוא שומט את שרביטו וניגש אליה, בתקווה להוציא ממנה תגובה, אך לשוא. לפתע הוא ראה את דמותו של טום רידל מחייכת אליו ומחזיקה את שרביטו. בנקודה זאת אנו מבינים את התרחשות האירועים. רידל מסביר שהוא זיכרון של עצמו אשר נשמר ביומנו במשך חמישים שנה. הוא מסביר אף שהוא, טום רידל, היה זה שפתח את חדר הסודות לפני חמישים שנה ותכנן לטהר את בית הספר מבני המוגלגים. היות ודמבלדור פקח עליו עין, לא הייתה לו ברירה אלא לזנוח את משימתו ולהאשים את האגריד בפתיחת החדר. הוא לא רצה שמאמציו בדבר מציאת החדר ירדו לטמיון, ולכן שימר את זכרונותיו ביומן, בתקווה שייפול לידיים של תלמיד שיעזור לו להשלים את המשימה שהתחיל.
במהלך שנת הלימודים, קיים רידל קשר עם ג'יני באמצעות היומן, בדומה לקשר שקיים עם הארי באותו לילה בו הראה לו את זכרונו. ג'יני העבירה לידיו סודות רבים שהעיקו על ליבה, וכך השתלט על נשמתה. רידל התחזק בהדרגה, ניזון מסודותיה של ג'יני. הוא העביר חלק מנשמתו אליה והשתמש בגופה כדי לפתוח מחודשות את החדר ולבצע סדרה חדשה של תקיפות. ג'יני, שלמרות שלא זכרה דבר ממעשיה הצליחה לקשור את עצמה למעשים, החלה לחשוד ביומן והורידה אותו באסלה קצת לפני שהארי מצא אותו. כשהיא ראתה את הארי עם היומן ביום האהבה היא חששה שרידל יגלה לו את כל סודותיה ולכן גנבה אותו מחדרו של הארי. כשהיומן חזר לידיה של ג'יני, הוא הורה לה לכתוב את הכתובת האחרונה על הקיר, לרדת לחדר הסודות ולחכות שהארי יבוא להציל אותה. מטרתו המחודשת של רידל, כמסתמן, הייתה להרוג את הארי פוטר.
בהמשך, רידל שואל את הארי כיצד הצליח להביס קוסם חזק כל כך כמו הלורד וולדמורט. כשהארי שואל אותה על פשר השאלה, זהותו האמיתית של טום רידל נחשפת - טום רידל הוא למעשה הלורד וולדמורט בצעירותו.
"וולדמורט," אמר רידל בשקט, "הוא העבר, ההווה והעתיד שלי, הארי פוטר..."
הוא שלף מכיסו את השרביט של הארי, והחל להניע אותו, כותב באוויר שלוש מילים נוצצות:
טום ואנדרולו רידל
ואז הוא הניף את השרביט פעם אחת, והאותיות שהרכיבו את שמו הסתדרו מחדש:
אני לורד וולדמורט
נוסף לגילוי המרעיש, רידל מציג קווי דימיון בינו לבין הארי עצמו. הוא מספר שהוא עצמו חצוי-דם, דובר לחשננית, יתום שגדל אצל מוגלגים. אימו קראה לו "טום" על שם אביו המוגל ו"ואנדרולו" על שם סבו הקוסם, שהיה נצר של סלזאר סלית'רין. הוא שינה את שמו ויצר אחד חדש, שידע שאנשים יפחדו להגיד היות והוא יהפוך לקוסם החזק ביותר בכל הזמנים. הארי, שמנסה למשוך זמן, טוען כי אלבוס דמבלדור הוא הקוסם הגדול ביותר בכל הזמנים. רידל משיב להארי כשהוא אומר שעצם הזיכרון שלו הצליח להוציא את דמבלדור מהטירה. הארי הנסער צועק שדמבלדור לא נעלם לחלוטין כמו שרידל מאמין שהוא. הארי מזמן בנאמנותו העמוקה את עוף החול של דמבלדור (פוקס), שהביא איתו גם את מצנפת המיון, שניהם נראים חסרי תועלת לעומת הבסיליסק שרידל מזמן.
תועלתו האמיתית של עוף החול מתגלה כשהוא מנכר את עיניו של הבסיליסק, ובכך מונע ממנו להרוג את הארי בעזרת מבט המוות שלו. גם ללא המבט שלו, הבסיליסק מסכן את הארי בשיניו שנוטפות ארס קטלני. בייאוש, הארי חובש את מצנפת המיון ומתחנן לעזרה.
במקום תשובה, חרב ארוכה וכסופה משובצת אבני אודם מופיעה לפתע במצנפת. לאחר מספר נסיונות כושלים, הארי מצליח לנעוץ את החרב בחלק העליון של לוע הבסיליסק, ובכך להרוג את המפלצת. לצערו, אחת משיניו נוטפות הארס של הבסיליסק ננעצת בזרועו. כשהארי כמעט מאבד את הכרתו, פוקס מזיל על זרועו דמעות שנראות כפנינות, והפצע בידו של הארי נעלם. מדבריו הזועמים של רידל אנחנו מבינים שלדמעות עוף החול סגולות ריפוי.
הארי מבין שרידל גוזל את נשמתה של ג'יני, ובעזרתו של פוקס נועץ את שן הבסיליסק ביומן. דמותו של רידל נעלמת וכמות גדולה של דיו מתחילה להישפך מבין דפי היומן. מספר רגעים מאוחר יותר ג'יני מתעוררת, נסערת.
הארי וג'יני חוזרים חזרה לכיוונם של רון ושל לוקהרט, שלא היה לו מושג מי הוא והיכן הוא נמצא. כדי לטפס בחזרה לחדר השירותים של מירטל המייללת תופסים הארבעה בזנבו את עוף החול, שמטיס אותם במעלה הצינור.
הפרס של דובי
במשרד המנהל, מוצאים הארבעה את אלבוס דמבלדור, מינרווה מקגונגל, מולי וויזלי וארתור וויזלי, ששמחים לראות אותם בחיים. הארי חשש שיאשימו את ג'יני בפתיחת חדר הסודות, אך לשמחתו דמבלדור הבין שוולדמורט הוא האשם בתקיפות. כפרס על תרומה מיוחדת לבית הספר, מקבלים הארי ורון כל אחד מאתיים נקודות בית.
כשדמבלדור מבקש לדבר עם הארי בפרטיות, הארי מספר לו על נקודות הדמיון בינו לבין הלורד וולדמורט. דמבלדור מסביר שכאשר וולדמורט ניסה להרוג אותו, העביר לו מבלי שהתכוון חלק מהכוחות שלו, וביניהם את היכולת לדבר לחשננית. בנוסף לכך, הארי מביע את דאגתו מהשנה הראשונה, שמא הוא מתאים כתלמיד בית סלית'רין. כשדמבלדור שואל את הארי למה הוא חושב שמצנפת המיון מיינה אותו לבית גריפינדור, הארי מודה שהוא ביקש ממנה לא למיין אותו לסלית'רין. בתגובה, דמבלדור מפיג את חשושתיו של הארי ומסביר שהבחירות שלנו הן שקובעות מי אנחנו. הוא אף מצביע על החרב שנפלה מתוך מצנפת המיון, ומגלה להארי שזוהי חרבו של גודריק גריפינדור. דמבלדור טוען שרק תלמיד אמיתי בבית גריפינדור היה מסוגל לשלוף את החרב מהמצנפת.
"היא שיבצה אותי בגריפינדור," אמר הארי בקול מובס, "רק בגלל שביקשתי לא ללכת לסלית'רין..."
"בדיוק," אמר דמבלדור, ושוב חייך. "מה שעושה אותך שונה מאד מטום רידל. הבחירות שלנו, הארי, הן שמגלות מי אנחנו באמת - הרבה יותר מאשר היכולות שלנו."
כשהארי בדרכו למסדרון, לוציוס מאלפוי נע בכבדות לתוך משרדו של דמבלדור, מאוכזב מחזרתו. דמבלדור טוען שחבר המנהלים דרש ממנו לחזור לתפקידו לאחר שביתו של מר וויזלי נחטפה. הוא אף מזכיר את העובדה שלוציוס איים על חבר המנהלים שיקלל את משפחותיהם אם לא יפעלו לשם סילוקו של דמבלדור, ומודיע ללוציוס שהודח מהחבר.
דובי, גמדון הבית, פוסע בעקבותיו של לוציוס, מה שמעיד על כך שהוא בבעלות משפחת מאלפוי. דמבלדור ולוציוס מנהלים שיחה רגועה אך ארסית, במהלכה הארי, בעזרת הרמזים השקטים של דובי, חושף את העובדה לפיה לוציוס הוא זה שהחדיר את היומן של טום רידל לספריה של ג'יני, בעת שביקרה בחנות "כרך ודף בע"מ". דמבלדור מזהיר את לוציוס ממקרים דומים בעתיד.
ביודעין שגמדון בית ישתחרר מעבדות אם בעליו יתנו לו בגדים, הארי מערים על מאלפוי בכך שהוא עוטף את היומן באחת מהגרביים שלו ונותן לו את החבילה. מאלפוי משליך מיד את הגרב, ודובי תופס אותה. בזעם, לוציוס מנסה לפגוע בהארי, אך דובי, שהשתחרר לחופשי, מגן עליו.
בסעודה חגיגית שנמשכה עד לשעות הקטנות של הלילה, זוכה בית גריפינדור באליפות הבתים בפעם השנייה ברציפות. התלמידים המאובנים מתרפאים, האגריד משתחרר מאזקבאן, המבחנים של שנת הלימודים מבוטלים ודמבלדור מחפש מורה חדש להתגוננות מפני כוחות האופל. הספר מסתיים כשהארי עובר את המחסום הקסום בקינג קרוס, בחזרה לעולם המוגלגים.
"אבל הדוד והדודה שלך יהיו גאים בך כשהם ישמעו מה עשית השנה, לא?" אמרה הרמיוני כשהם ירדו מהרכבת והצטרפו לקהל שהתקבץ ליד מחסום הקסם.
"יהיו גאים בי?" אמר הארי. "השתגעת? כל הפעמים שהייתי יכול למות, ולא הצלחתי? הם יכעסו נורא..."
ויחד הם עברו בשער בחזרה לעולם המוגלגים.
0 חרמשים
